芜湖市第三人民医院（市传染病医院）创建于1973年，是省卫健委批准的政府举办的非营利性公共卫生事业单位,是皖南地区最早建立的传染病专科医院,亦是芜湖市政府指定的病毒性肝炎、肺结核、性病、艾滋病等感染性疾病定点医疗机构；主要承担一市四县和皖南地区的传染病防治任务。医院是芜湖市和宣城市职工、居民医保（新农合）定点医疗机构。医院现为北京地坛医院皖南合作医院，北京胸科医院、安徽省胸科医院结核病专科医疗联合体成员单位，安徽省感染性疾病专科联盟成员单位，长三角传染病防治医联体成员单位。现为芜湖市二院一体化管理医院。

医院感染病科（传染科目前包括：结核科、艾滋病科、肝病科）是市级西医重点培育专科，为省内较早开展人工肝治疗重症肝炎的专科医院之一。腹水浓缩回输技术治疗肝硬化腹水和血浆置换与自血光量子联合治疗重型肝炎等科研项目获省、市科技进步奖。

根据传染病归口管理的规定，2005年我院首次收治艾滋病病人，2015年1月我院被市卫健委确定为芜湖市结核病定点收治医疗机构和唯一结核病规范化管理门诊；医院建立的标准净化结核病耐多药实验室，为结核病诊治提供可靠依据。结核病门诊承担免费结核药发放与密切接触者免费筛查工作。2021年1月1日芜湖市艾滋病抗病毒治疗整体移交三院。

医院与北京胸科医院、安徽省胸科医院开展科研协作项目2项；承担芜湖市二院、芜湖市一院国家住院医师规范化培训与全科医师培训传染病专业带教任务和芜湖市结核病质量控制中心工作。是芜湖市结核病质量控制中心挂靠单位。

医院拥有DR、CR、CT等影像设备，彩色多普勒超声诊断仪、肺功能检查仪，常规开展电子支气管镜技术、电子胃镜技术、肺部病灶穿刺活检技术等；设有省级负压细菌实验室，开展各种病原体培养、鉴定、药敏（耐药）试验，结核菌快速检测等项目；常规开展结核菌分子生物学（TB-DNA与T-spot）、免疫学检测（结核抗体），PPD试验；正在开展Gene XpertMTB/RIF快速检测和液体培养结核菌工作，艾滋病病毒定量（HIVRNA）与CD⁺⁴、CD⁺⁸检测，为结核病、艾滋病诊断与治疗提供可靠依据和技术支撑。

医院目前开展市级科研项目1项，芜湖市卫健委科研2项，院级新项目新技术10余项，新冠期间取得市级科研成果3项，医务人员先后在国家级学术期刊发表学术论文近百篇。

医院经过50年的建设与发展,如今已发展成为专科优势显著,诊疗设备先进,医疗技术全面,科研实力较强、管理方法科学的一所集医疗预防、教学、科研功能于一体的二级传染病专科医院，我院将以市二院一体化管理医院为契机，加快感染病学科建设，使之成为芜湖市特色专科医院。